Codon Usage Frequency Table

Inquiry

Escherichia coli (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.58 0.42 0.14 0.13	22.1 16.0 14.3 13.0	80995 58774 52382 47500	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.17 0.15 0.14 0.14	10.4 9.1 8.9 8.5	38027 33430 32715 31146
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.59 0.41 0.61 0.09	17.5 12.2 2.0 0.3	63937 44631 7356 989	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.46 0.54 0.30 1.00	5.2 6.1 1.0 13.9	19138 22188 3623 50991
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.12 0.10 0.04 0.47	11.9 10.2 4.2 48.4	43449 37347 15409 177210	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.18 0.13 0.20 0.49	7.5 5.4 8.6 20.9	27340 19666 31534 76644
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.57 0.43 0.34 0.66	12.5 9.3 14.6 28.4	45879 34078 53394 104171	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.36 0.36 0.07 0.11	20.0 19.7 3.8 5.9	73197 72212 13844 21552
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.49 0.39 0.11 1.00	29.8 23.7 6.8 26.4	109072 86796 24984 96695	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.19 0.40 0.17 0.25	10.3 22.0 9.3 13.7	37842 80547 33910 50269
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.49 0.51 0.74 0.26	20.6 21.4 35.3 12.4	75436 78443 129137 45459	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.16 0.25 0.07 0.04	9.9 15.2 3.6 2.1	36097 55551 13152 7607
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.28 0.20 0.17 0.35	19.8 14.3 11.6 24.4	72584 52439 42420 89265	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.18 0.26 0.23 0.33	17.1 24.2 21.2 30.1	62479 88721 77547 110308
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.63 0.37 0.68 0.32	32.7 19.2 39.1 18.7	119939 70394 143353 68609	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.35 0.37 0.13 0.15	25.5 27.1 9.5 11.3	93325 99390 34799 41277

Arabidopsis thaliana (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.51 0.49 0.13 0.22	21.9 20.7 12.6 20.9	534456 505253 308336 508909	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.28 0.13 0.20 0.10	25.0 11.1 18.1 9.2	610403 270545 440264 223500
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.52 0.48 0.36 0.20	14.8 13.9 0.9 0.5	359583 337738 22128 12250	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.59 0.41 0.44 1.00	10.4 7.1 1.1 12.5	254179 171924 26304 304101
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.26 0.17 0.11 0.11	24.2 16.1 9.9 9.9	589767 391502 240784 240472	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.38 0.11 0.33 0.17	18.7 5.3 16.2 8.5	455638 129838 393957 207684
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.61 0.39 0.56 0.44	13.7 8.7 19.3 15.2	334012 211635 470475 371091	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.17 0.07 0.12 0.09	9.0 3.8 6.3 4.8	220192 91869 152537 117195
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.41 0.35 0.24 1.00	21.7 18.6 12.5 24.4	528593 452968 305594 594807	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.34 0.20 0.30 0.15	17.7 10.4 15.7 7.7	431031 252577 381774 186589
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.52 0.48 0.48 0.52	22.3 20.9 30.7 32.8	543539 508277 749448 798966	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.16 0.13 0.35 0.20	13.9 11.2 18.8 10.9	339903 273815 457927 266406
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.41 0.19 0.15 0.26	27.4 12.8 10.0 17.4	668037 312848 242644 423929	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.44 0.16 0.27 0.14	28.6 10.4 17.6 8.9	697575 253877 427842 217886
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.68 0.32 0.52 0.49	36.7 17.2 34.3 32.3	895566 420193 836077 786970	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.34 0.14 0.37 0.15	22.4 9.2 24.3 10.2	546544 223041 592219 249165

Caenorhabditis elegan (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.50 0.50 0.12 0.23	23.9 24.0 10.2 20.1	253139 253770 107678 212079	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.21 0.13 0.25 0.15	16.8 10.7 20.4 12.1	177232 112689 215921 127964
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.56 0.44 0.44 0.17	17.6 13.7 1.6 0.6	185598 145166 16504 6683	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.55 0.45 0.39 1.00	11.2 9.1 1.4 11.0	118546 95986 14942 116700
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.24 0.17 0.09 0.14	21.1 14.9 7.9 12.1	223106 157716 83312 128045	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.18 0.09 0.53 0.20	8.9 4.5 25.9 9.6	93596 47421 273982 101820
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.61 0.39 0.66 0.34	14.1 9.2 27.2 14.2	148752 97770 287219 150209	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.21 0.10 0.23 0.09	11.3 5.2 11.9 4.7	119070 54826 126093 49450
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.53 0.31 0.16 1.00	32.4 18.9 9.6 25.9	342216 200325 101184 274027	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.33 0.18 0.34 0.15	18.9 10.5 19.8 8.9	199854 110926 209655 93703
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.62 0.38 0.59 0.41	30.3 18.4 37.9 26.0	319819 194728 400356 274667	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.15 0.10 0.29 0.08	12.1 8.3 15.5 4.0	127651 87812 163895 42185
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.39 0.22 0.16 0.23	24.0 13.6 9.9 14.3	253488 143320 104173 151285	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.36 0.20 0.31 0.13	22.3 12.6 19.6 8.2	235555 133544 207269 86490
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.68 0.33 0.62 0.38	35.5 17.1 40.6 24.4	375420 181100 429632 258278	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.20 0.12 0.59 0.08	11.0 6.7 31.5 4.5	116505 70868 332512 47074

Cricetulus griseus (CHO) (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.47 0.53 0.07 0.14	19.6 22.0 6.4 14.1	3005 3381 978 2169	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.22 0.22 0.14 0.05	16.0 16.5 10.3 3.4	2450 2529 1577 529
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.44 0.56 0.26 0.22	13.1 16.4 0.6 0.5	2017 2519 93 84	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.47 0.53 0.53 1.00	9.1 10.3 1.2 13.1	1397 1589 177 2012
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.13 0.19 0.08 0.39	13.2 18.4 7.6 38.8	2023 2818 1174 5955	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.31 0.32 0.29 0.08	16.7 17.0 15.6 4.3	2563 2608 2388 657
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.44 0.56 0.24 0.76	10.2 12.9 10.3 33.4	1563 1980 1587 5122	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.11 0.18 0.14 0.19	5.6 9.3 7.2 10.1	863 1429 1102 1558
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.35 0.51 0.14 1.00	17.4 24.8 6.9 23.0	2673 3808 1053 3538	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.26 0.37 0.29 0.08	14.1 20.3 15.7 4.5	2172 3118 2418 685
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.45 0.55 0.39 0.61	17.4 21.2 24.6 38.4	2671 3248 3782 5895	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.15 0.22 0.19 0.19	11.4 16.4 10.1 10.2	1756 2521 1557 1570
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.18 0.24 0.12 0.46	11.6 15.7 7.8 30.1	1780 2408 1202 4628	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.32 0.37 0.23 0.07	22.4 25.9 16.3 5.0	3432 3973 2497 765
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.47 0.53 0.41 0.59	24.6 28.1 28.4 41.1	3781 4310 4355 6311	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.20 0.34 0.25 0.21	12.8 21.3 15.8 13.4	1968 3268 2425 2063

Drosophila melanogaster (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.37 0.63 0.05 0.18	13.1 21.9 4.4 16.0	241160 402987 80654 294929	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.08 0.24 0.09 0.20	6.9 19.5 7.8 16.7	127758 359352 142775 307642
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.37 0.63 0.42 0.32	10.7 18.4 0.8 0.6	196987 338493 14550 11721	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.29 0.71 0.26 1.00	5.3 13.1 0.5 9.8	98056 241823 9358 181191
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.10 0.15 0.09 0.43	8.9 13.9 8.2 38.5	164079 255170 150674 709057	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.13 0.33 0.25 0.29	6.9 18.0 13.5 16.0	127584 331799 248604 293998
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.40 0.60 0.30 0.70	10.5 16.0 15.6 36.7	194039 294555 287398 674575	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.16 0.33 0.15 0.15	8.8 18.2 8.5 8.2	161800 334733 155637 151728
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.34 0.47 0.19 1.00	16.4 22.9 9.3 23.5	302063 421851 171610 431822	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.17 0.38 0.19 0.26	9.5 21.4 10.9 14.5	175261 393516 201178 267095
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.44 0.56 0.29 0.71	21.0 26.3 16.5 39.6	385441 483430 304266 729428	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.14 0.25 0.09 0.11	11.5 20.5 5.1 6.3	211452 377750 93738 115430
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.18 0.24 0.11 0.47	10.9 13.9 6.3 28.0	200189 254974 116035 514471	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.19 0.45 0.17 0.19	14.4 33.7 12.7 14.1	265295 620889 234549 259119
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.53 0.47 0.33 0.67	27.4 24.7 20.9 42.9	504880 454677 383850 789807	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.21 0.43 0.29 0.07	13.2 26.8 17.8 4.6	243460 492283 326983 85472

Human (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.45 0.55 0.07 0.13	16.9 20.4 7.2 12.6	336562 406571 143715 249879	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.18 0.22 0.15 0.06	14.6 17.4 11.7 4.5	291040 346943 233110 89429
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.43 0.57 0.28 0.20	12.0 15.6 0.7 0.5	239268 310695 14322 10915	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.45 0.55 0.52 1.00	9.9 12.2 1.3 12.8	197293 243685 25383 255512
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.13 0.20 0.07 0.41	12.8 19.4 6.9 40.3	253795 386182 138154 800774	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.28 0.33 0.27 0.11	17.3 20.0 16.7 7.0	343793 397790 331944 139414
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.41 0.59 0.25 0.75	10.4 14.9 11.8 34.6	207826 297048 234785 688316	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.08 0.19 0.11 0.21	4.7 10.9 6.3 11.9	93458 217130 126113 235938
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.36 0.48 0.16 1.00	15.7 21.4 7.1 22.3	313225 426570 140652 443795	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.24 0.36 0.28 0.12	12.8 19.2 14.8 6.2	255582 382050 294223 123533
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.46 0.54 0.42 0.58	16.7 19.5 24.0 32.9	331714 387148 476554 654280	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.15 0.24 0.20 0.20	11.9 19.4 11.5 11.4	237404 385113 228151 227281
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.18 0.24 0.11 0.47	10.9 14.6 7.0 28.9	216818 290874 139156 575438	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.26 0.40 0.23 0.11	18.6 28.5 16.0 7.6	370873 567930 317338 150708
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.46 0.54 0.42 0.58	22.3 26.0 29.0 40.8	443369 517579 577846 810842	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.16 0.34 0.25 0.25	10.8 22.8 16.3 16.4	215544 453917 325243 326879

Insect (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.25 0.75 0.07 0.20	9.2 27.3 5.7 15.9	263 786 165 458	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.19 0.24 0.16 0.12	10.8 14.1 9.2 7.2	310 405 264 208
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.25 0.75 0.68 0.15	8.1 24.1 2.8 0.6	232 694 81 18	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.35 0.65 0.17 1.00	6.9 12.8 0.7 11.3	199 369 20 325
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.13 0.22 0.08 0.31	10.3 18.1 6.1 25.2	297 521 175 724	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.29 0.31 0.24 0.16	14.3 14.8 11.5 7.9	410 425 331 226
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.32 0.68 0.39 0.61	7.9 16.6 15.2 23.3	226 476 437 671	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.25 0.24 0.08 0.05	17.2 16.4 5.5 3.4	495 472 157 98
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.29 0.59 0.12 1.00	15.1 30.4 6.0 26.8	434 873 173 770	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.27 0.36 0.21 0.16	13.8 18.5 10.7 8.2	397 531 308 235
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.29 0.71 0.31 0.69	11.7 28.3 26.0 57.2	336 814 746 1644	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.12 0.17 0.16 0.21	6.7 10.1 11.2 14.3	194 289 322 411
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.20 0.30 0.15 0.35	14.2 21.4 10.8 25.4	407 614 310 731	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.36 0.30 0.16 0.18	27.0 22.7 11.8 13.3	775 653 339 381
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.37 0.63 0.41 0.59	19.1 32.9 25.0 36.2	550 947 718 1041	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.36 0.32 0.27 0.05	23.1 20.6 17.8 3.3	663 592 511 96

Mouse (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.43 0.57 0.06 0.13	17.1 22.3 6.5 13.3	244935 319002 92974 189840	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.19 0.22 0.14 0.05	15.9 18.1 11.6 4.3	228046 258787 165371 61116
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.43 0.58 0.26 0.22	12.2 16.5 0.6 0.5	175198 236579 8861 7491	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.48 0.52 0.52 1.00	11.1 12.1 1.2 12.4	158573 173509 17004 177261
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.13 0.20 0.08 0.39	13.2 20.3 8.0 40.0	188236 290198 114707 571592	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.30 0.31 0.28 0.10	18.3 18.4 17.1 6.3	261478 262874 244064 89477
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.40 0.60 0.25 0.75	10.2 15.2 11.4 34.0	145279 217261 163794 486041	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.09 0.18 0.12 0.19	4.7 9.5 6.6 10.3	66962 136330 94626 147905
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.34 0.50 0.16 1.00	15.6 23.2 7.2 23.1	223528 332072 103441 330431	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.25 0.35 0.29 0.11	13.6 19.2 15.9 5.8	194120 274588 227958 82653
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.43 0.57 0.39 0.61	15.5 20.7 21.3 33.7	221760 296083 305128 482643	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.15 0.24 0.21 0.22	12.3 19.5 11.4 11.7	176056 279098 163062 167166
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.17 0.25 0.12 0.46	10.7 15.7 7.4 29.1	152706 224465 105532 416428	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.29 0.38 0.23 0.10	20.1 26.4 15.8 6.6	288132 378142 226309 94463
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.44 0.56 0.40 0.60	21.1 26.6 26.5 39.4	301359 380355 379216 563999	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.18 0.33 0.26 0.23	11.5 21.9 16.9 15.4	164971 312846 241435 220474

Nicotiana tabacum (Tabacco) (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.58 0.42 0.14 0.24	24.4 17.8 12.5 21.9	10395 7569 5334 9315	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.26 0.14 0.23 0.07	20.3 10.7 17.7 5.4	8634 4542 7543 2290
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.57 0.43 0.41 0.19	17.8 13.5 1.1 0.5	7573 5737 486 224	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.57 0.43 0.41 1.00	9.9 7.6 1.1 11.6	4233 3225 455 4921
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.26 0.14 0.10 0.12	23.7 12.2 9.2 10.4	10079 5176 3935 4431	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.37 0.13 0.40 0.10	18.8 6.7 20.0 4.9	8012 2862 8540 2098
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.61 0.39 0.58 0.42	13.3 8.6 21.3 15.5	5650 3672 9069 6618	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.15 0.08 0.11 0.08	7.4 4.0 5.1 3.7	3173 1688 2179 1573
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.50 0.25 0.25 1.00	27.3 13.7 13.9 24.8	11626 5823 5914 10543	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.39 0.19 0.33 0.09	20.8 10.0 17.4 4.6	8844 4251 7420 1946
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.60 0.40 0.49 0.51	27.4 18.6 32.3 33.9	11684 7922 13750 14437	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.17 0.13 0.32 0.26	13.3 10.0 15.5 12.5	5657 4262 6586 5309
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.41 0.17 0.17 0.25	27.0 11.4 11.2 16.6	11505 4855 4755 7057	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.44 0.17 0.31 0.08	32.0 12.6 23.0 5.8	13610 5373 9805 2490
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.68 0.32 0.55 0.45	36.7 16.9 35.0 29.1	15612 7219 14896 12401	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.34 0.17 0.34 0.15	23.1 11.4 23.5 10.5	9831 4854 10006 4482

Pichia pastoris (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.56 0.44 0.15 0.33	23.9 19.1 14.9 31.4	1013 810 634 1332	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.29 0.20 0.19 0.09	23.5 16.3 15.6 7.2	996 693 663 305
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.45 0.55 0.53 0.29	14.7 18.3 0.9 0.5	622 777 38 21	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.65 0.35 0.18 1.00	8.3 4.5 0.3 9.9	353 191 13 418
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.17 0.08 0.12 0.16	16.0 7.6 11.2 15.3	677 321 475 648	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.35 0.16 0.40 0.10	15.3 6.7 17.1 4.1	648 285 725 172
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.54 0.46 0.62 0.38	10.5 8.9 23.9 14.5	447 378 1015 616	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.16 0.05 0.11 0.05	6.9 2.3 4.6 2.2	291 99 195 93
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.51 0.31 0.18 1.00	31.7 19.3 11.5 19.2	1347 819 486 813	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.40 0.24 0.25 0.11	23.3 13.7 14.3 6.3	989 580 605 267
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.48 0.52 0.47 0.53	23.5 25.7 30.2 34.4	998 1090 1280 1460	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.15 0.09 0.47 0.16	12.1 7.4 19.9 6.6	514 315 846 281
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.42 0.23 0.16 0.20	26.7 14.5 10.1 12.8	1131 615 430 543	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.45 0.25 0.24 0.06	29.6 16.7 15.9 3.7	1256 707 675 158
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.59 0.41 0.58 0.42	37.2 26.2 40.2 29.6	1578 1110 1706 1255	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.43 0.14 0.32 0.10	26.6 8.6 20.0 6.4	1130 365 849 271

Pig (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.38 0.62 0.06 0.10	16.5 27.2 6.7 10.7	9682 15970 3904 6291	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.15 0.26 0.15 0.06	11.0 18.6 10.9 4.1	6467 10920 6395 2415
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.35 0.65 0.13 0.08	11.1 20.5 0.7 0.4	6509 12028 384 250	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.39 0.61 0.79 1.00	8.8 13.6 4.2 13.8	5189 8002 2462 8101
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.10 0.21 0.13 0.40	10.5 22.5 13.6 42.8	6171 13175 7968 25098	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.24 0.35 0.27 0.13	14.3 20.6 15.9 7.7	8418 12079 9337 4531
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.34 0.66 0.25 0.75	8.3 16.1 10.6 31.6	4850 9423 6208 18519	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.07 0.22 0.12 0.20	3.7 10.9 6.1 10.3	2174 6370 3607 6054
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.30 0.53 0.18 1.00	16.5 29.3 10.0 21.2	9653 17201 5874 12424	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.19 0.41 0.26 0.13	10.9 23.2 14.9 7.3	6379 13626 8768 4263
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.37 0.63 0.40 0.60	14.2 24.2 20.6 30.7	8328 14191 12102 18000	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.12 0.26 0.19 0.20	8.2 18.3 9.4 9.9	4802 10718 5490 5805
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.14 0.27 0.12 0.48	9.0 17.1 7.4 30.9	5261 10030 4343 18102	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.24 0.45 0.20 0.11	16.4 30.7 13.9 7.7	9606 18003 8161 4491
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.38 0.62 0.38 0.62	17.2 28.5 23.1 37.4	10082 16733 13534 21938	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.14 0.36 0.26 0.24	9.5 24.7 17.4 16.3	5569 14478 10200 9552

Rat (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.41 0.59 0.06 0.12	16.5 24.0 5.6 12.4	67342 97917 22946 50586	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.18 0.23 0.14 0.06	14.5 18.1 10.7 4.4	59379 73906 43498 17938
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.40 0.60 0.27 0.23	11.7 17.6 0.6 0.5	47581 71817 2487 2003	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.45 0.56 0.50 1.00	9.7 12.1 1.1 13.3	39593 49606 4323 54121
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.12 0.21 0.07 0.42	12.1 20.7 7.3 41.2	49547 84406 29920 168065	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.30 0.32 0.27 0.11	17.1 18.3 15.8 6.4	69680 74530 64570 26151
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.38 0.62 0.25 0.75	9.2 14.9 10.8 33.0	37758 60682 44091 134878	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.09 0.18 0.12 0.20	4.9 10.0 6.6 10.7	20024 41025 27045 43511
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.32 0.54 0.14 1.00	15.5 25.6 6.7 23.7	63414 104432 27251 96623	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.23 0.37 0.28 0.12	12.8 20.3 15.1 6.4	52394 82782 61774 26019
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.40 0.60 0.37 0.63	15.1 22.5 20.8 35.0	61847 92081 84916 142997	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.15 0.25 0.20 0.21	11.6 19.4 10.6 11.5	47538 79105 43324 47066
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.16 0.26 0.11 0.47	10.2 16.7 7.0 30.4	41475 68342 28503 124205	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.28 0.40 0.22 0.10	19.5 27.6 15.3 6.9	79794 112838 62476 28040
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.42 0.58 0.39 0.61	20.8 28.4 26.3 40.5	84969 116171 107203 165509	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.17 0.34 0.25 0.24	11.3 22.4 16.6 15.8	46093 91387 67691 64344

Saccharomyces cerevisiae (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.59 0.41 0.28 0.29	26.1 18.4 26.2 27.2	170666 120510 170884 177573	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.26 0.16 0.21 0.10	23.5 14.2 18.7 8.6	153557 92923 122028 55951
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.56 0.44 0.48 0.22	18.8 14.8 1.1 0.5	122728 96596 6913 3312	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.63 0.37 0.30 1.00	8.1 4.8 0.7 10.4	52903 31095 4447 67789
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.13 0.06 0.14 0.11	12.3 5.4 13.4 10.5	80076 35545 87619 68494	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.31 0.15 0.42 0.12	13.5 6.8 18.3 5.3	88263 44309 119641 34597
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.64 0.36 0.69 0.31	13.6 7.8 27.3 12.1	89007 50785 178251 79121	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.14 0.06 0.07 0.04	6.4 2.6 3.0 1.7	41791 16993 19562 11351
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.46 0.26 0.27 1.00	30.1 17.2 17.8 20.9	196893 112176 116254 136805	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.35 0.22 0.30 0.14	20.3 12.7 17.8 8.0	132522 83207 116084 52045
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.59 0.41 0.58 0.42	35.7 24.8 41.9 30.8	233124 162199 273618 201361	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.16 0.11 0.48 0.21	14.2 9.8 21.3 9.2	92466 63726 139081 60289
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.39 0.21 0.21 0.19	22.1 11.8 11.8 10.8	144243 76947 76927 70337	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.38 0.22 0.29 0.11	21.2 12.6 16.2 6.2	138358 82357 105910 40358
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.65 0.35 0.70 0.30	37.6 20.2 45.6 19.2	245641 132048 297944 125717	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.47 0.19 0.22 0.12	23.9 9.8 10.9 6.0	156109 63903 71216 39359

Streptomyces (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.02 0.98 0.00 0.02	0.4 25.9 0.1 2.4	1234 72059 179 6779	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.01 0.41 0.02 0.28	0.6 20.2 1.1 13.7	1803 56276 3013 38183
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.05 0.95 0.03 0.17	1.0 19.5 0.1 0.5	2727 54303 395 1479	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.09 0.91 0.80 1.00	0.7 7.1 2.4 15.1	2004 19634 6617 42057
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.02 0.36 0.00 0.60	1.6 36.6 0.4 60.9	4459 101750 997 169359	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.02 0.41 0.02 0.54	1.5 25.4 1.3 33.3	4294 70794 3746 92793
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.07 0.93 0.05 0.95	1.7 21.8 1.4 25.3	4740 60728 3759 70449	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.07 0.47 0.03 0.38	5.5 39.2 2.6 31.8	15259 108957 7181 88441
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.02 0.96 0.02 1.00	0.6 27.6 0.7 15.8	1759 76866 1850 43995	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.02 0.65 0.03 0.31	1.2 39.8 1.6 18.9	3330 110711 4581 52727
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.04 0.96 0.05 0.95	0.7 16.3 1.1 19.7	2002 45375 2959 54924	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.03 0.25 0.01 0.04	1.5 12.4 0.8 3.7	4219 34568 2165 10191
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.02 0.55 0.03 0.41	1.5 46.9 2.7 34.9	4063 130645 7402 97199	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.02 0.57 0.04 0.36	3.1 78.4 5.6 49.4	8535 218103 15633 137587
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.05 0.95 0.15 0.85	3.1 58.2 8.7 48.4	8523 162110 24291 134604	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.10 0.64 0.08 0.19	9.2 61.0 7.2 18.1	25651 169647 19941 50450

Yeast (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.59 0.41 0.28 0.29	26.1 18.2 26.4 27.1	147662 103110 149466 153307	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.26 0.16 0.21 0.10	23.6 14.2 18.8 8.6	133502 80612 106266 48524
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.56 0.44 0.48 0.24	18.8 14.7 1.0 0.5	106420 83100 5596 2681	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.63 0.37 0.29 1.00	8.0 4.7 0.6 10.3	45222 26520 3516 58416
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.13 0.06 0.14 0.11	12.2 5.4 13.4 10.4	68959 30501 75775 59027	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.31 0.15 0.41 0.12	13.6 6.8 18.2 5.3	77061 38414 103062 29916
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.64 0.36 0.69 0.31	13.7 7.8 27.5 12.2	77724 44082 155751 68932	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.15 0.06 0.07 0.04	6.5 2.6 3.0 1.7	36693 14645 17111 9872
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.46 0.26 0.27 1.00	30.2 17.1 17.8 20.9	171272 96735 100930 118274	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.35 0.22 0.30 0.13	20.3 12.6 17.8 7.9	114746 71204 100680 44995
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.59 0.41 0.58 0.42	36.0 24.9 42.2 30.8	204015 141103 239186 174250	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.16 0.11 0.48 0.21	14.2 9.7 21.3 9.2	80293 54825 120587 52322
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.39 0.21 0.21 0.19	22.0 11.6 11.8 10.6	124665 65664 66649 60286	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.38 0.22 0.29 0.11	21.1 12.5 16.2 6.1	119402 71065 91502 34754
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.65 0.35 0.71 0.29	37.8 20.3 45.9 19.1	214363 114918 260082 108411	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.47 0.19 0.22 0.12	23.9 9.7 10.9 6.0	135417 54977 61825 33885

Zea mays (maize) (standard genetic code)

Codon	AA	Fraction	Frequency	Number	Codon	AA	Fraction	Frequency	Number
TTT TTC TTA TTG	F F L L	0.37 0.63 0.08 0.15	13.9 24.1 7.8 13.7	10405 18021 5819 10227	TCT TCC TCA TCG	S S S S	0.17 0.22 0.15 0.14	12.6 15.8 11.1 9.9	9418 11779 8270 7391
TAT TAC TAA TAG	Y Y * *	0.37 0.63 0.24 0.32	10.7 18.6 0.6 0.8	7989 13868 447 568	TGT TGC TGA TGG	C C * W	0.34 0.66 0.44 1.00	6.0 11.6 1.1 13.1	4502 8650 828 9747
CTT CTC CTA CTG	L L L L	0.18 0.25 0.08 0.25	16.4 23.6 7.8 23.6	12255 17598 5856 17602	CCT CCC CCA CCG	P P P P	0.24 0.24 0.26 0.26	13.4 13.3 14.2 14.5	10004 9946 10609 10802
CAT CAC CAA CAG	H H Q Q	0.43 0.57 0.39 0.61	10.6 13.9 15.0 23.0	7896 10355 11189 17187	CGT CGC CGA CGG	R R R R	0.12 0.23 0.09 0.15	6.6 13.1 4.9 8.6	4912 9761 3662 6442
ATT ATC ATA ATG	I I I M	0.33 0.47 0.20 1.00	16.0 22.8 9.4 23.7	11943 17033 7049 17706	ACT ACC ACA ACG	T T T T	0.24 0.33 0.22 0.21	12.0 16.2 10.7 10.2	8958 12066 7987 7650
AAT AAC AAA AAG	N N K K	0.40 0.60 0.30 0.70	14.7 21.8 16.8 39.5	10987 16252 12567 29494	AGT AGC AGA AGG	S S R R	0.11 0.21 0.16 0.25	8.3 15.2 9.2 14.1	6219 11381 6855 10527
GTT GTC GTA GTG	V V V V	0.24 0.29 0.11 0.36	16.4 19.9 7.2 24.5	12238 14896 5370 18314	GCT GCC GCA GCG	A A A A	0.25 0.33 0.19 0.23	22.4 29.3 16.6 20.9	16694 21904 12429 15610
GAT GAC GAA GAG	D D E E	0.44 0.56 0.36 0.64	23.8 30.5 21.8 39.4	17764 22752 16250 29427	GGT GGC GGA GGG	G G G G	0.21 0.39 0.20 0.21	15.2 28.2 14.5 15.1	11380 21059 10838 11275

Creative Biostructure has been working in the field of structural biology, membrane protein technologies, and structure-based drug discovery. Feel free to discuss your research project with our experts.

Online Inquiry

This site is protected by reCAPTCHA and the Google Privacy Policy and Terms of Service apply.

Inquiry Basket

Advertisement

Learn More